1. 研究目的与意义

研究背景：

1.1胰腺癌的背景和发病率

胰腺癌是一种常见的消化道恶性肿瘤，占所有癌症的2%，发病率在过去几年里逐渐增加。胰腺癌早期症状不明显，具有高度侵袭性，会迅速扩散到周围器官，因此是致死率最高的癌症之一，占癌症相关死亡的5%。胰腺癌多由癌症相关基因的遗传种系或体细胞获得性突变引起的，突变也会导致癌症进展和转移。

胰腺癌的发病原因至今仍未完全查明，某些已知的诱因包括吸烟、显性遗传家族史、糖尿病、饮食因素、体重超标、缺乏运动、饮酒，主要见于男性和中老年(40-85岁)^[1]。

2. 研究内容和预期目标

本课题将从公共数据库TCGA和GEO进行数据挖掘，检索胰腺癌-正常样本对照的转录表达数据并进行差异表达分析，从中筛选获得表达水平和胰腺癌患者生存及预后显著相关基因，对其中参与调控P53相关基因进行表达水平和分类能力评价，构建ROC诊断模型。此外，还将对P53相关胰腺癌差异表达基因进行功能、通路分析和互作用网络构建，系统揭示其在胰腺癌调控中的分子机制。

3. 研究的方法与步骤

1、从msigdb数据库v7.1（msigdb）下载并通过pubmed文献检索获取p53相关基因。

2、从geo数据库下载胰腺癌及正常样本基因芯片数据与相关临床数据，使用geo2r按照log2fc绝对值大于2与fdr小于0.05的标准筛选出差异基因，并用tcga中的rna-seq数据验证差异表达，绘制基因表达热图和火山图。

3、利用gepia在线分析p53相关差异基因表达水平与临床病理特征(t分期、病理分期、临床特征)的相关性和显著性。

4. 参考文献

[1] liu x, zhang l, thu pm, min w, yang p, li j, li p, xu x. sodium cantharidinate, a novel anti-pancreatic cancer agent that activates functional p53. sci china life sci. 2021 aug;64(8):1295-1310. doi: 10.1007/s11427-019-1753-3. epub 2020 nov 3. pmid: 33165811.

[2] springfeld c, jager d, buchler mw, et al. chemotherapy forpancreatic cancer. presse med. 2019;48(3 pt 2):e159-e174. doi:10.1016/j.lpm.2019.02.025

5. 计划与进度安排

1、第1周～第2周 接受任务，按照指导教师要求查阅资料，撰写开题报告。

2、第3周～第4周 进行数据收集，熟悉相关程序软件，数据的预处理等。

3、第5周～第8周 标准筛选出差异基因，并用tcga中的rna-seq数据验证差异表达，绘制基因表达热图和火山图。